WEKO3
アイテム
Structure comparison of heme-binding sites in heme protein predicted by AlphaFold3 and AlphaFold2
https://kitami-it.repo.nii.ac.jp/records/2000915
https://kitami-it.repo.nii.ac.jp/records/20009151ad15d06-0859-419a-a54b-ac02de7948ae
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
upae148.pdf (3.2 MB)
|
.png)
|
| Item type | デフォルトアイテムタイプ（シンプル）(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2025-09-25 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | Structure comparison of heme-binding sites in heme protein predicted by AlphaFold3 and AlphaFold2 | |||||||
| 言語 | en | |||||||
| その他のタイトル | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 作成者 |
Hiroko X. Kondo
× Hiroko X. Kondo× Yu Takano
|
|||||||
| アクセス権 | ||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||||
| 権利者情報 | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 主題 | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | AlphaFold3 | |||||||
| 主題 | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | heme protein | |||||||
| 主題 | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | pocket conformation | |||||||
| 内容記述 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||
| 内容記述 | AlphaFold3 can predict protein–ligand complex structures. In this study, we examined the accuracy of prediction of heme–protein interactions by AlphaFold3. AlphaFold3 succeeded in predicting heme–protein interactions for most heme proteins except for those without homologous proteins in the Protein Data Bank. Our comparison of predictions by AlphaFold3 and AlphaFold2 suggests that heme–protein structures can be predicted from amino acid sequences of proteins alone using AlphaFold2. | |||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 出版者 | ||||||||
| 出版者 | Oxford University Press | |||||||
| 言語 | en | |||||||
| 出版者 | ||||||||
| 出版者 | The Chemical Society of Japan | |||||||
| 言語 | en | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | eng | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子（シンプル） | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||
| 資源タイプ（シンプル） | journal article | |||||||
| 出版タイプ | ||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||
| 関連情報 | ||||||||
| 関連タイプ | isIdenticalTo | |||||||
| 識別子タイプ | DOI | |||||||
| 関連識別子 | https://doi.org/10.1093/chemle/upae148 | |||||||
| 助成情報 | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| 収録物識別子 | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | EISSN | |||||||
| 収録物識別子 | 13480715 | |||||||
| 書誌情報 |
en : Chemistry Letters 巻 53, 号 8, p. 1-5, 発行日 2024-08 |
|||||||
